More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1404 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  60.81 
 
 
294 aa  362  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.97 
 
 
295 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.43 
 
 
295 aa  342  5e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.03 
 
 
295 aa  340  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.52 
 
 
294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.19 
 
 
294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.19 
 
 
294 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0686  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.73 
 
 
296 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0122169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.51 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.95 
 
 
288 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 
287 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
290 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.93 
 
 
287 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.01 
 
 
290 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.42 
 
 
288 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  35.14 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
289 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.27 
 
 
287 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  35.95 
 
 
302 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.93 
 
 
287 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.03 
 
 
293 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.36 
 
 
289 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  35 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.06 
 
 
295 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 
290 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  34.52 
 
 
303 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
289 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
295 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.46 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.88 
 
 
291 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
287 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
290 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  35.69 
 
 
287 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.48 
 
 
287 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
286 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  34.95 
 
 
291 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.55 
 
 
291 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
291 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.55 
 
 
291 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
291 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
291 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.84 
 
 
291 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
291 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
291 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
291 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.24 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  33.91 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.22 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.52 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
288 aa  172  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
288 aa  172  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.78 
 
 
286 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  34.71 
 
 
286 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
288 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
286 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
286 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
286 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  35.02 
 
 
287 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.56 
 
 
287 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  32.65 
 
 
288 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>