More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1060 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  69.55 
 
 
289 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  54.39 
 
 
295 aa  316  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  57.48 
 
 
293 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  61.54 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  53.58 
 
 
297 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  53.79 
 
 
294 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  51.52 
 
 
294 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  49.13 
 
 
290 aa  270  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
295 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.49 
 
 
287 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
287 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 
287 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
287 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 
287 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.64 
 
 
288 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  40.13 
 
 
309 aa  234  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
291 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
291 aa  228  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.18 
 
 
290 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 
292 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 
299 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 
293 aa  221  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.11 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
286 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 
290 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.83 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.83 
 
 
290 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
290 aa  214  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.31 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.69 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
290 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
289 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 
290 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.3 
 
 
283 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
292 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.98 
 
 
296 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 
295 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.11 
 
 
281 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.46 
 
 
296 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
292 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 
315 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  35.65 
 
 
345 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.87 
 
 
287 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
288 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
288 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
292 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  39.52 
 
 
288 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
288 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.98 
 
 
287 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  40.2 
 
 
292 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
291 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
290 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
298 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
296 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  38.61 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
283 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.03 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 
295 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
288 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
288 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
288 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  38.75 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.93 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
294 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
316 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  39.73 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.1 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.98 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
315 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 
286 aa  195  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.75 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  39.37 
 
 
286 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
291 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
296 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.77 
 
 
291 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
286 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
294 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
290 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>