More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16521 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.37 
 
 		 316 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 316 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.2 
 
 		 316 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.94 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.46 
 
 		 316 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.14 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.14 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.52 
 
 		 316 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.48 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.94 
 
 		 317 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.1 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.15 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  61.46 
 
 		 315 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.51 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  51.78 
 
 		 369 aa  332  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  52.62 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.34 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.22 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.03 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  38.05 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.3 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.34 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.79 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  38.24 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  36.45 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  35.94 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.67 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  36.67 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  36.59 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  35.65 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.94 
 
 		 288 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  36.51 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.54 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  34.34 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  35.76 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.86 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.85 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.54 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  37.14 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  35.56 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>