More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4137 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 326 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  62.58 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.04 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.04 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.04 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  60.67 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.46 
 
 		 309 aa  358  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.85 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.45 
 
 		 305 aa  355  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  58.75 
 
 		 306 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  57.23 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  57.76 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.07 
 
 		 298 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  54.68 
 
 		 304 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.56 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.94 
 
 		 309 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  54.27 
 
 		 308 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.63 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.7 
 
 		 298 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  53.66 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  54.95 
 
 		 306 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  52.78 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  52.55 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.72 
 
 		 297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  51.27 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  49.38 
 
 		 298 aa  292  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.52 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  48.45 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.99 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.22 
 
 		 297 aa  286  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  54.31 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.84 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  49.22 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  47.71 
 
 		 306 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  47 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.57 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  42.06 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  42.2 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  38.62 
 
 		 315 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  39.1 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.33 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  37.34 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 		 281 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.25 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  36.16 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.63 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  36.47 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  36.96 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.25 
 
 		 290 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.6 
 
 		 298 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.89 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  35.83 
 
 		 287 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.53 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.97 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.97 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.65 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.75 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.75 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.89 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  34.07 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  33.02 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.13 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  33.84 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.67 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.23 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.26 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  34.94 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.75 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  32.5 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.35 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  33.23 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.12 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  32.19 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>