More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0147 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 334 aa  689    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.34 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.01 
 
 		 298 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  47.24 
 
 		 298 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  45.32 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  44.82 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  44.95 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.87 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  40.91 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  42.11 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  41.3 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  41.76 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.52 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  39.47 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.48 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  39.51 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  41.98 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.09 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  38.25 
 
 		 304 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  37.88 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  39.2 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.94 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  38.58 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  37.65 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  35.09 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  39.12 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  37.99 
 
 		 304 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  37.72 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  36.63 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.61 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.31 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  32.43 
 
 		 291 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.79 
 
 		 281 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  32.01 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  31.07 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.73 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  30.24 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.43 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.83 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  30.09 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.61 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  32.52 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.83 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.91 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.36 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.43 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.39 
 
 		 290 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  30.03 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.31 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  29.79 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.66 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  30.35 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.4 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.38 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.32 
 
 		 282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  28.79 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.48 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.88 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  29.1 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.04 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.88 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.88 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.04 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  28.57 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.31 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.18 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  29.43 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  29.48 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.75 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.75 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.1 
 
 		 287 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.96 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  30.06 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.27 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.88 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.57 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.22 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.27 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.96 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.48 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.48 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.48 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>