More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1124 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  71.34 
 
 
334 aa  461  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  51.66 
 
 
298 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  51.83 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  51.5 
 
 
299 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  52.49 
 
 
298 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  49.83 
 
 
297 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  45.75 
 
 
300 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.87 
 
 
297 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  44.75 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.54 
 
 
302 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  42.95 
 
 
310 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.55 
 
 
296 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.31 
 
 
309 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  42.99 
 
 
311 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.85 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  41.37 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.59 
 
 
298 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  45.12 
 
 
304 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  42.76 
 
 
306 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  43.57 
 
 
326 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  43.29 
 
 
299 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  41.37 
 
 
306 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.85 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.85 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.85 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.8 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  42.62 
 
 
300 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.91 
 
 
298 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.59 
 
 
300 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  38.73 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  41.1 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  41.85 
 
 
312 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  40.06 
 
 
306 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  41.42 
 
 
312 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.88 
 
 
309 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 
309 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  39.81 
 
 
308 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  33.22 
 
 
287 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.46 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  33.55 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.01 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  32.67 
 
 
289 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  33.11 
 
 
291 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
285 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  31.31 
 
 
286 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.69 
 
 
288 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  31.25 
 
 
295 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  34.11 
 
 
299 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.69 
 
 
288 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.11 
 
 
298 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.69 
 
 
287 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.02 
 
 
288 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  31.02 
 
 
291 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  31.19 
 
 
290 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.69 
 
 
283 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
288 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
288 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.64 
 
 
289 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.39 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.03 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  34.08 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  33 
 
 
287 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
282 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  31.95 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.01 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  32.89 
 
 
285 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.98 
 
 
288 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.36 
 
 
287 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  31.29 
 
 
297 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  34.12 
 
 
285 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.36 
 
 
287 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.27 
 
 
290 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.68 
 
 
295 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.29 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.27 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.46 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.48 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  31.23 
 
 
305 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.62 
 
 
287 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  33.11 
 
 
285 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.71 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.42 
 
 
292 aa  146  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  29.63 
 
 
288 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.03 
 
 
290 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  30.79 
 
 
302 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  32.78 
 
 
287 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  30.31 
 
 
315 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>