More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1639 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  42.71 
 
 
287 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.79 
 
 
281 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  42.32 
 
 
292 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.24 
 
 
290 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  41.56 
 
 
306 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
282 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  43.24 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  41.36 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
287 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 
298 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  42.07 
 
 
310 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 
298 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.58 
 
 
283 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
287 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 
285 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
288 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 
283 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
288 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  41.67 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.61 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.16 
 
 
287 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  42.23 
 
 
300 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  40.2 
 
 
311 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
295 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  40.21 
 
 
285 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
290 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
286 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  41.05 
 
 
300 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  39.8 
 
 
304 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  40.85 
 
 
299 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
290 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  40.19 
 
 
326 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
290 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
290 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
289 aa  203  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  39.59 
 
 
303 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.55 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  40.72 
 
 
312 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.53 
 
 
295 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
288 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
288 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
289 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 
287 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
286 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.52 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  40.27 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.16 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
293 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 
289 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 
289 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  40.55 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  38.06 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.1 
 
 
287 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
288 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
288 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.58 
 
 
291 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
287 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
298 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
285 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
293 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
315 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
314 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
289 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 
297 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.93 
 
 
292 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.49 
 
 
345 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  38.03 
 
 
310 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  34.93 
 
 
291 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
315 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  39.46 
 
 
294 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>