More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1023 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  84.18 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  61.67 
 
 		 304 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  60.19 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.51 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.48 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.15 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.2 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.25 
 
 		 305 aa  335  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  56.03 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.61 
 
 		 302 aa  335  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.22 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.22 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.22 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  58.78 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  58.05 
 
 		 298 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  56.4 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  55.37 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  56.07 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  53.75 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  57.44 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.12 
 
 		 297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  55.85 
 
 		 299 aa  318  7.999999999999999e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  52.12 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.12 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  57 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  55.02 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  58.42 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.84 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  54.39 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.21 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  54.05 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  52.72 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  50.33 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  52.98 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  53.9 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.14 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.59 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  38.48 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.21 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.64 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.41 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.75 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.39 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  40.68 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.2 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.2 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.2 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  41.5 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.92 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  41.55 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.86 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.92 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  40.77 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  41.38 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  40.86 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.86 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  41.5 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.4 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  39.74 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  39.3 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.53 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.13 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  39.04 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  40.34 
 
 		 285 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.33 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>