More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1269 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  65.2 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.42 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  62.78 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  61.41 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  60.07 
 
 		 298 aa  358  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.67 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  59.4 
 
 		 297 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.97 
 
 		 296 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.61 
 
 		 298 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  59.2 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  57.67 
 
 		 304 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  57.81 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.72 
 
 		 297 aa  339  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  58.7 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.94 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  57.24 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.55 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.26 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  54.63 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  54.02 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  58.22 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  55.86 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  55.41 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.16 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.16 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.16 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.15 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  54.25 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  51.3 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  52.48 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.52 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  51.16 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.9 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  50 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  50 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  51.13 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.54 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  41.52 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.64 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  41.53 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  42.25 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 281 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  38.57 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  38.96 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.43 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 		 287 aa  195  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.61 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.27 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.39 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  40.4 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.27 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.74 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  39.75 
 
 		 315 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.67 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  40.33 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  36.92 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  42.12 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.27 
 
 		 287 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  38 
 
 		 287 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.27 
 
 		 287 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  39.02 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.33 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  35.81 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  37.71 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  38.78 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>