More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2449 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  74.07 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  73.31 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  68.46 
 
 
299 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  67.46 
 
 
297 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.08 
 
 
297 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.49 
 
 
307 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  54.34 
 
 
310 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.24 
 
 
297 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.61 
 
 
296 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.74 
 
 
302 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  54.39 
 
 
303 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.17 
 
 
298 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  45.57 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.92 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.05 
 
 
298 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  52.26 
 
 
299 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  49.17 
 
 
304 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.17 
 
 
311 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  48.64 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  48.3 
 
 
306 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  47.96 
 
 
326 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.18 
 
 
309 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.85 
 
 
309 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.85 
 
 
305 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  50.52 
 
 
300 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  47.25 
 
 
312 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  46.15 
 
 
306 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.53 
 
 
309 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.53 
 
 
309 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.53 
 
 
309 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  48.16 
 
 
312 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  48.97 
 
 
304 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  44.22 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  44.3 
 
 
310 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  44.48 
 
 
308 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.89 
 
 
309 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.23 
 
 
309 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
288 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  34.8 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  36.09 
 
 
299 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.78 
 
 
298 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.27 
 
 
281 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.24 
 
 
287 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 
314 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 
288 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.72 
 
 
289 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.12 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 
286 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  36.17 
 
 
291 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.67 
 
 
286 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.82 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.59 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 
289 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.27 
 
 
285 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
286 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.41 
 
 
289 aa  162  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
288 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
288 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
286 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 
282 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.59 
 
 
286 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.66 
 
 
290 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.66 
 
 
287 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.13 
 
 
315 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
315 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.77 
 
 
287 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
293 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.66 
 
 
287 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.77 
 
 
288 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  33.22 
 
 
287 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
287 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.88 
 
 
287 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.88 
 
 
287 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>