More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6137 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  66.24 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  66.12 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.31 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.31 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.31 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  59.45 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  61.04 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.34 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.01 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.45 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.21 
 
 		 305 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.81 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  61.04 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  60.39 
 
 		 308 aa  335  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.02 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  57.05 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  53.69 
 
 		 299 aa  321  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  54.4 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.17 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  52.4 
 
 		 300 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.92 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.13 
 
 		 297 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.88 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  51.32 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  50.96 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  52.65 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.48 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  49.04 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  48.86 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.58 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  46.84 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.88 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.06 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  47.21 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  48.16 
 
 		 298 aa  251  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  43.13 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.42 
 
 		 307 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.47 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  37.72 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.88 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.88 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  37.42 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.02 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  39.6 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 		 288 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  37.08 
 
 		 315 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.67 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.74 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.42 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  35.92 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  37.04 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 287 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.27 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  38 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.96 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  36.88 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  36.33 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.67 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.33 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.12 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.12 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  36.88 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.12 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.88 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>