More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  100 
 
 
304 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  52.49 
 
 
299 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.84 
 
 
297 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  50.67 
 
 
298 aa  281  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  51.17 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  48.49 
 
 
303 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  49.34 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.83 
 
 
297 aa  271  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.84 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50 
 
 
302 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  47.49 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  45.33 
 
 
304 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.67 
 
 
300 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  46.95 
 
 
310 aa  261  6.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.79 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.14 
 
 
298 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.47 
 
 
309 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  42.58 
 
 
311 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.77 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  47 
 
 
298 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  42.76 
 
 
299 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  44.55 
 
 
312 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  42.2 
 
 
326 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  44.3 
 
 
306 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  45.63 
 
 
308 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  43.13 
 
 
312 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  45.05 
 
 
304 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  40.78 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  43.1 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.65 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.83 
 
 
309 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.9 
 
 
309 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  40.91 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  39.41 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  37.99 
 
 
334 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  36.54 
 
 
299 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
282 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.45 
 
 
287 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.45 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
287 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.77 
 
 
290 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
298 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
281 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  32.41 
 
 
287 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  32.53 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.03 
 
 
287 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.9 
 
 
289 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.42 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
286 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
286 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
291 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
295 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.77 
 
 
286 aa  148  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.09 
 
 
287 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.72 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.31 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  33.68 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.76 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>