More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1315 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  100 
 
 
312 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.38 
 
 
309 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.74 
 
 
309 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  62.3 
 
 
311 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  61.04 
 
 
312 aa  358  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  57.23 
 
 
326 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  56.87 
 
 
310 aa  350  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.35 
 
 
305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.35 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.35 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.35 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  55.45 
 
 
308 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  53.25 
 
 
306 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.23 
 
 
297 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.52 
 
 
309 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  52.75 
 
 
299 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  50.48 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.9 
 
 
298 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  51.95 
 
 
298 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.58 
 
 
309 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.31 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  50.48 
 
 
300 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.24 
 
 
300 aa  298  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  49.19 
 
 
298 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  51.61 
 
 
297 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  49.5 
 
 
299 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  51.96 
 
 
306 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.13 
 
 
302 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.27 
 
 
296 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  51.16 
 
 
300 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.59 
 
 
310 aa  290  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  47.63 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.64 
 
 
304 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.95 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  45.08 
 
 
306 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  44.55 
 
 
304 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  46.91 
 
 
298 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.85 
 
 
307 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  39.12 
 
 
334 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.66 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.65 
 
 
315 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 
288 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  39.02 
 
 
315 aa  208  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
315 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
288 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38 
 
 
288 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.02 
 
 
285 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
289 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.81 
 
 
314 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
316 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 
282 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.5 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.5 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39 
 
 
287 aa  195  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39 
 
 
287 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39 
 
 
287 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 
283 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
287 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.2 
 
 
287 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.67 
 
 
286 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.67 
 
 
286 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 
283 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
287 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.07 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.04 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>