More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1254 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  74.6 
 
 		 310 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  60.26 
 
 		 311 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.5 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.5 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.5 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  61.04 
 
 		 312 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.58 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  58.44 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.46 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.13 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.12 
 
 		 298 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  58.03 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  52.09 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  50.84 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.22 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.82 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.84 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  53.25 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  49.34 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  50.17 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  50 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  50 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.16 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  45.13 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  46.84 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.37 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.7 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.64 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  45.89 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  46.38 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  47.85 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  47.49 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.75 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.71 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  44.22 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.06 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.86 
 
 		 291 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 288 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  40.91 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  37.65 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  40.4 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.69 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.13 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  36.67 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.83 
 
 		 285 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.81 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.81 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.27 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  36.51 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.75 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.86 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.83 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.41 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.41 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.27 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>