More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  61.61 
 
 		 303 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.78 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.19 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  59.55 
 
 		 298 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  58.31 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.48 
 
 		 297 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  57.65 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.13 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  56.35 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.02 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.31 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  55.1 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.63 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  54.33 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  53.05 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  52.82 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  50.97 
 
 		 300 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  53.33 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  50.17 
 
 		 299 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.53 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.84 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  49.37 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.8 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.28 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  47.99 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.65 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.65 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.65 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  48.59 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.62 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  46.95 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  47.95 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  45.89 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  47.3 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.12 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  46.43 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  42.11 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.74 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.19 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.07 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.03 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.4 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  40.66 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.66 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.43 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  40.13 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.7 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  38.11 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  38.99 
 
 		 315 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  38.24 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.05 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  36.58 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  36.33 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  39.74 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  36.33 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.34 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.74 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 		 283 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.18 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  39 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>