More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1299 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
305 aa  631  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  46.93 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  48.2 
 
 
302 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  43.75 
 
 
303 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.27 
 
 
283 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.44 
 
 
287 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  37.54 
 
 
295 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 
295 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  37.79 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.97 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.97 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
287 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
287 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  34.49 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 
288 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  33.99 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.32 
 
 
288 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
293 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  34.64 
 
 
309 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.98 
 
 
285 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.03 
 
 
305 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  34.11 
 
 
291 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.99 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  34.98 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.13 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  35.37 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 
293 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  36.3 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  32.58 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  35.31 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.28 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  33.66 
 
 
297 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  36.39 
 
 
297 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 
287 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.45 
 
 
289 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
288 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  33.97 
 
 
308 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
287 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
291 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.68 
 
 
290 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.41 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
298 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.2 
 
 
286 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
287 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.79 
 
 
295 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.98 
 
 
285 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
288 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
288 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.54 
 
 
289 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.82 
 
 
295 aa  169  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.75 
 
 
290 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  33.65 
 
 
311 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.32 
 
 
283 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.75 
 
 
290 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.91 
 
 
315 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  32.45 
 
 
289 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.91 
 
 
289 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.1 
 
 
290 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
291 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
290 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.23 
 
 
316 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  33.02 
 
 
310 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  34.68 
 
 
299 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.79 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.42 
 
 
286 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  33.75 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  32.45 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
287 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0107  ATP synthase F1, gamma subunit  32.45 
 
 
298 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0013955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.67 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.09 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  33.67 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.89 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.07 
 
 
309 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.98 
 
 
291 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>