More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7249 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
294 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  56.55 
 
 
294 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  55.86 
 
 
297 aa  318  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  53.95 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  52.07 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  53.79 
 
 
286 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.63 
 
 
295 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.75 
 
 
291 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.4 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.55 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.93 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.1 
 
 
290 aa  265  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  48.63 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.59 
 
 
292 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  44.67 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.86 
 
 
287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.45 
 
 
288 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.17 
 
 
287 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 
288 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.83 
 
 
287 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
283 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.67 
 
 
287 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
288 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.53 
 
 
309 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.61 
 
 
290 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 
289 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.61 
 
 
290 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
290 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  41.52 
 
 
287 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.89 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  37.28 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  44.2 
 
 
270 aa  212  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 
289 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
295 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
282 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.45 
 
 
286 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
290 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.45 
 
 
286 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
283 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 
294 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
288 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
288 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
285 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  39.37 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.45 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  37.37 
 
 
291 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
298 aa  195  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
290 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.4 
 
 
291 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  35.74 
 
 
292 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 
292 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.18 
 
 
286 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.92 
 
 
298 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  37.24 
 
 
287 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  36.67 
 
 
295 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.24 
 
 
290 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.24 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.24 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
296 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.03 
 
 
296 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  36.42 
 
 
369 aa  188  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.42 
 
 
288 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.42 
 
 
288 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
292 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  38.1 
 
 
294 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
291 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
291 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  35.18 
 
 
308 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
293 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  36.46 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 
291 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.17 
 
 
291 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
294 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.84 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
294 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  38.54 
 
 
302 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>