More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1543 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
316 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.2 
 
 
316 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.89 
 
 
316 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.94 
 
 
316 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.41 
 
 
316 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.41 
 
 
316 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.46 
 
 
316 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.48 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.75 
 
 
316 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.21 
 
 
317 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.42 
 
 
315 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.78 
 
 
316 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
315 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  61.78 
 
 
315 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.46 
 
 
314 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.24 
 
 
314 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 
314 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 
314 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  52.43 
 
 
369 aa  333  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  53.23 
 
 
365 aa  330  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
287 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.9 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
288 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.87 
 
 
287 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
288 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.66 
 
 
286 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  38.12 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
283 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
286 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
287 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
290 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.89 
 
 
291 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  38.05 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.85 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.3 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
287 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
282 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  36.16 
 
 
295 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.03 
 
 
289 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.77 
 
 
295 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
286 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.32 
 
 
288 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
286 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
287 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
287 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
298 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
288 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
286 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.16 
 
 
289 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  35.62 
 
 
288 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  37.93 
 
 
309 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 
281 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
286 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
286 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
286 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
283 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  36.28 
 
 
290 aa  192  8e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
287 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
286 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 
288 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.67 
 
 
289 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.28 
 
 
288 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  36.83 
 
 
286 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
286 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  36.36 
 
 
326 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
286 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 
287 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.24 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
290 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
290 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  35.13 
 
 
287 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.24 
 
 
288 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.2 
 
 
291 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  35.76 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
289 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>