More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1710 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  61.54 
 
 
286 aa  325  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  56.67 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  47.1 
 
 
294 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  48.38 
 
 
297 aa  248  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  48.91 
 
 
295 aa  248  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  48.35 
 
 
293 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.76 
 
 
287 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.13 
 
 
287 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.24 
 
 
287 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.57 
 
 
295 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.75 
 
 
287 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.75 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.33 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.75 
 
 
291 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  41.24 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  44.2 
 
 
294 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.52 
 
 
288 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.75 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.52 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  43.43 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
291 aa  208  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 
289 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.75 
 
 
290 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.08 
 
 
299 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.73 
 
 
290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.12 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.51 
 
 
291 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.5 
 
 
290 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.5 
 
 
290 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.11 
 
 
283 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.81 
 
 
281 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.92 
 
 
296 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
290 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.41 
 
 
282 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.63 
 
 
290 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
294 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.32 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  36.77 
 
 
305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.04 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  41.07 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.82 
 
 
298 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  38.1 
 
 
292 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.56 
 
 
290 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  42.12 
 
 
287 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.24 
 
 
287 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.92 
 
 
290 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.43 
 
 
296 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.68 
 
 
294 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.27 
 
 
288 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.27 
 
 
288 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.32 
 
 
290 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
295 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.9 
 
 
287 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
291 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
290 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.4 
 
 
286 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.68 
 
 
291 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.96 
 
 
292 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.66 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  36.36 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  32.63 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.82 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.04 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.4 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  36.16 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.07 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.27 
 
 
289 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
315 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  37.64 
 
 
287 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.32 
 
 
293 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.89 
 
 
291 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.09 
 
 
293 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  35.94 
 
 
294 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.93 
 
 
288 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.46 
 
 
289 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.23 
 
 
293 aa  168  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.96 
 
 
288 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  35.59 
 
 
299 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.16 
 
 
287 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  35.93 
 
 
286 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.96 
 
 
288 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.58 
 
 
289 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.79 
 
 
286 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.69 
 
 
289 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.56 
 
 
296 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
296 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.01 
 
 
294 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.06 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.23 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.69 
 
 
289 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  33.21 
 
 
287 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
291 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>