More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1026 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  60.34 
 
 
286 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
283 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.23 
 
 
283 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
281 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
290 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.87 
 
 
315 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
289 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
287 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 
288 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
282 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
288 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
315 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
314 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
287 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
287 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 
291 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.29 
 
 
315 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.23 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.24 
 
 
290 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  35.69 
 
 
308 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
290 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  36.73 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.03 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  35.67 
 
 
287 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
314 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
286 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.59 
 
 
290 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 
288 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 
288 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.54 
 
 
316 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
291 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.03 
 
 
298 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  35.08 
 
 
309 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.02 
 
 
295 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  36.3 
 
 
286 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 
288 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.45 
 
 
290 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  35.71 
 
 
295 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.7 
 
 
286 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
290 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
293 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.78 
 
 
290 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  36.04 
 
 
291 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  35.95 
 
 
294 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.78 
 
 
290 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
289 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 
298 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 
293 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.24 
 
 
291 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  31.97 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
285 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.12 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
288 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
288 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.45 
 
 
287 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  33.33 
 
 
297 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
292 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.89 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.45 
 
 
287 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.54 
 
 
290 aa  178  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
293 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  32.09 
 
 
345 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 
287 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.24 
 
 
292 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  35.91 
 
 
286 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  32.2 
 
 
293 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
291 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  34.45 
 
 
294 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  32.67 
 
 
294 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.49 
 
 
305 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
289 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  32.78 
 
 
305 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  32.35 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  33.78 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.64 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>