More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0172 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.16 
 
 
291 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.16 
 
 
291 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  85.96 
 
 
292 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  89.73 
 
 
292 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  90.07 
 
 
292 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  87.33 
 
 
292 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.16 
 
 
291 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.15 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.93 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.83 
 
 
292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.42 
 
 
293 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.54 
 
 
295 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.55 
 
 
296 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.32 
 
 
296 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.53 
 
 
296 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.67 
 
 
290 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.99 
 
 
294 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  65.31 
 
 
294 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.67 
 
 
291 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.49 
 
 
296 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.63 
 
 
294 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.1 
 
 
292 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.48 
 
 
290 aa  355  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.82 
 
 
293 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.16 
 
 
292 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.16 
 
 
292 aa  350  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.11 
 
 
291 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.19 
 
 
299 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.34 
 
 
294 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.51 
 
 
289 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.17 
 
 
289 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.82 
 
 
294 aa  338  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.51 
 
 
289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.51 
 
 
290 aa  335  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.1 
 
 
302 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 
291 aa  298  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.77 
 
 
296 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.56 
 
 
293 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  55.89 
 
 
295 aa  287  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.22 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  48.63 
 
 
292 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  41.95 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  41.41 
 
 
294 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 
290 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.92 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
287 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.99 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
287 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
282 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.6 
 
 
290 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
288 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
289 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
287 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.8 
 
 
291 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  39.46 
 
 
297 aa  208  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.61 
 
 
287 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
290 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
290 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  40.91 
 
 
309 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
288 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
288 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.08 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  39 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.12 
 
 
283 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
290 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
285 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.16 
 
 
298 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  41.16 
 
 
305 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
291 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.2 
 
 
295 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  37.33 
 
 
294 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
291 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  36.77 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  35.8 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
291 aa  188  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
281 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.26 
 
 
299 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
298 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
286 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
293 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.76 
 
 
295 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
293 aa  178  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>