More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1557 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.51 
 
 
291 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.14 
 
 
309 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
295 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.13 
 
 
289 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
291 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.68 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.59 
 
 
288 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.13 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 
286 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  40.55 
 
 
289 aa  189  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
293 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 
287 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 
281 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
292 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 
290 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.42 
 
 
283 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 
288 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.6 
 
 
286 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  35.74 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.54 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.91 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.91 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  34.97 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  33.45 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  35.54 
 
 
286 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.19 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
290 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.48 
 
 
315 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
290 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 
288 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.54 
 
 
315 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  34.81 
 
 
294 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  33.68 
 
 
287 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.15 
 
 
287 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.4 
 
 
287 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  34.89 
 
 
291 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.76 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.02 
 
 
314 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 
286 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.29 
 
 
289 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.02 
 
 
314 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  33.78 
 
 
297 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  32.8 
 
 
315 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.15 
 
 
286 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
290 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  32.75 
 
 
287 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
287 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
290 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.46 
 
 
289 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 
294 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 
287 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.48 
 
 
289 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.48 
 
 
289 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.66 
 
 
316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.3 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.55 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  36.18 
 
 
287 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.3 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.78 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.3 
 
 
288 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
287 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  32.32 
 
 
290 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  35.54 
 
 
286 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 
287 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.9 
 
 
294 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 
287 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.56 
 
 
294 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.07 
 
 
287 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  34.29 
 
 
308 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 
287 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.42 
 
 
294 aa  169  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 
287 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
287 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
287 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.71 
 
 
288 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  31.58 
 
 
345 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.53 
 
 
286 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>