More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4738 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.2 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.34 
 
 
291 aa  349  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.34 
 
 
292 aa  348  6e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.69 
 
 
292 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.69 
 
 
291 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.69 
 
 
291 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.61 
 
 
292 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60 
 
 
292 aa  341  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  62.03 
 
 
294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.36 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.68 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.03 
 
 
292 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.45 
 
 
293 aa  332  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.47 
 
 
296 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.63 
 
 
295 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.06 
 
 
296 aa  331  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
292 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
292 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
292 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.31 
 
 
291 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.07 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.18 
 
 
290 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.98 
 
 
294 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.45 
 
 
296 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.31 
 
 
294 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.9 
 
 
290 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.84 
 
 
299 aa  308  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.31 
 
 
290 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.25 
 
 
294 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.58 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.61 
 
 
293 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
289 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
289 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  55.37 
 
 
295 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.66 
 
 
302 aa  291  8e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.25 
 
 
289 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.54 
 
 
291 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.51 
 
 
293 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.38 
 
 
296 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.2 
 
 
290 aa  248  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  44.59 
 
 
292 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  43.29 
 
 
295 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.05 
 
 
290 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.4 
 
 
288 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.08 
 
 
287 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 
287 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
287 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
287 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
287 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.23 
 
 
283 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 
288 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  39.6 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  40.13 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.93 
 
 
298 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
282 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
288 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
288 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  39.13 
 
 
294 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 
295 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.19 
 
 
298 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.6 
 
 
290 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.47 
 
 
289 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
290 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 
294 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.13 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
283 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.37 
 
 
286 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
290 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.92 
 
 
291 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 
291 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.27 
 
 
295 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  36.86 
 
 
309 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.11 
 
 
305 aa  185  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.13 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 
293 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.91 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0269811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
281 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  38.85 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  35.69 
 
 
292 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
288 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
293 aa  175  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  36.49 
 
 
294 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  34.88 
 
 
365 aa  175  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  35.24 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  36.76 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  38.33 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0388  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.9 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.803559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  36.15 
 
 
286 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  36.61 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.07 
 
 
291 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>