More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2401 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.2 
 
 
294 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.29 
 
 
291 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.73 
 
 
291 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.9 
 
 
290 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.39 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.3 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.55 
 
 
290 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.14 
 
 
292 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.5 
 
 
299 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.45 
 
 
292 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.61 
 
 
291 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  54.08 
 
 
294 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 
296 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.05 
 
 
296 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.56 
 
 
295 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.17 
 
 
289 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 
296 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.17 
 
 
289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.17 
 
 
289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.56 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.17 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.61 
 
 
291 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 
294 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.04 
 
 
294 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.67 
 
 
292 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.9 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.53 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.58 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.58 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.42 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.05 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.22 
 
 
291 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.92 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.22 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.95 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.88 
 
 
291 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.03 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  52 
 
 
295 aa  255  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.7 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  48.45 
 
 
292 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 
293 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.3 
 
 
287 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.47 
 
 
283 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.77 
 
 
287 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.43 
 
 
287 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.48 
 
 
287 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.62 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.45 
 
 
282 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 
290 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 
281 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  43.96 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.75 
 
 
289 aa  214  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.24 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  41.69 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  42.52 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
290 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
288 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
288 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  42.21 
 
 
305 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  40.8 
 
 
293 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
288 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
288 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
298 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.39 
 
 
294 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.09 
 
 
289 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.44 
 
 
290 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
295 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  42.04 
 
 
309 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.81 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  40.21 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  42 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.43 
 
 
290 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.43 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.36 
 
 
287 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 
291 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.48 
 
 
295 aa  195  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
286 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  39.5 
 
 
315 aa  195  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
286 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.91 
 
 
289 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.19 
 
 
316 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.12 
 
 
290 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.49 
 
 
287 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
287 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 
290 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
286 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
286 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.16 
 
 
291 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  38.57 
 
 
286 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 
286 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.75 
 
 
291 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  37.58 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>