More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3961 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  79.73 
 
 		 641 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  77.63 
 
 		 645 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  81.96 
 
 		 645 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  79.73 
 
 		 641 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  73.97 
 
 		 655 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3961  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 891 aa  1847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  79.68 
 
 		 645 aa  682    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  79.86 
 
 		 1191 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  73.35 
 
 		 658 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  70.23 
 
 		 655 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  74.14 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  72.05 
 
 		 655 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  72.34 
 
 		 655 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  71 
 
 		 655 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  71 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  69.84 
 
 		 655 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  69.55 
 
 		 655 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  69.25 
 
 		 655 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  59.45 
 
 		 650 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  59.82 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  56.98 
 
 		 636 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.65 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.45 
 
 		 633 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  54 
 
 		 648 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  58.62 
 
 		 633 aa  485  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 637 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  57.05 
 
 		 649 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  59.08 
 
 		 640 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  62.05 
 
 		 635 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  58.12 
 
 		 634 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 		 644 aa  482  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  57.88 
 
 		 644 aa  482  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  55.76 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  56.95 
 
 		 794 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  59.73 
 
 		 640 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.1 
 
 		 644 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.32 
 
 		 628 aa  478  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 		 825 aa  473  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  57.24 
 
 		 802 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  56.01 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.65 
 
 		 675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  56.04 
 
 		 637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  55.58 
 
 		 802 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  55.96 
 
 		 651 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  56.59 
 
 		 645 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.47 
 
 		 633 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  55.1 
 
 		 648 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  56.42 
 
 		 641 aa  465  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  57.47 
 
 		 795 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  60.5 
 
 		 638 aa  466  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  60.96 
 
 		 638 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  60.73 
 
 		 638 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.04 
 
 		 644 aa  465  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.52 
 
 		 635 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  55.61 
 
 		 642 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  55.18 
 
 		 641 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  54.05 
 
 		 637 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  58.18 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  55.96 
 
 		 795 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  53.9 
 
 		 662 aa  459  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  56.06 
 
 		 640 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 651 aa  458  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 652 aa  459  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  52.84 
 
 		 643 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  53.39 
 
 		 649 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  57.5 
 
 		 640 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  54.34 
 
 		 795 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  54.82 
 
 		 796 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  57.27 
 
 		 640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 		 652 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 		 796 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  53.2 
 
 		 654 aa  452  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.07 
 
 		 638 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  56.39 
 
 		 643 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.63 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.48 
 
 		 633 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  52.09 
 
 		 686 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.82 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.23 
 
 		 635 aa  452  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  51.54 
 
 		 644 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  53.32 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  52.17 
 
 		 727 aa  450  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.53 
 
 		 642 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.05 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.57 
 
 		 642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.72 
 
 		 636 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.72 
 
 		 636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  52.59 
 
 		 659 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.39 
 
 		 643 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  51.97 
 
 		 644 aa  445  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.84 
 
 		 637 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 		 661 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  52.39 
 
 		 650 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.11 
 
 		 665 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>