More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3165 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3165  inner-membrane translocator  100 
 
 		 364 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3028  inner-membrane translocator  74.84 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1463  inner-membrane translocator  69.85 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0757  inner-membrane translocator  72.58 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3830  inner-membrane translocator  50.41 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.34 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  30.37 
 
 		 355 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 321 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.8 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 571 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  31.09 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.02 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 589 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  32 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.69 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.7 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22990  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  32.9 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0910597  normal  0.0451282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4821  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0314054  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.95 
 
 		 646 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  31.9 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  30.47 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  34.55 
 
 		 832 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.42 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.11 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  33.77 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 463 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>