77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2766 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  66.67 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  66.49 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  61.83 
 
 		 188 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  61.29 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  61.99 
 
 		 216 aa  214  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  58.79 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  61.2 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  56.25 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  52.08 
 
 		 192 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  60.98 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  54.55 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  53.41 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  53.41 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  53.41 
 
 		 186 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  57.74 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  59.15 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  59.76 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  56.4 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  51.26 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  56.6 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  50.58 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  47.64 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  47.64 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  49.17 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  48.17 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  51.18 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  48.35 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  45.37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  48.59 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  47.98 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  52.73 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  48.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  50.3 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  44.9 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  48.78 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  44.61 
 
 		 242 aa  147  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  44.86 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  50.59 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  48.15 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  43.33 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  43.4 
 
 		 174 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  46.59 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  46.79 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  45.41 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  44.86 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  42.46 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  47.4 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  43.02 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  41.57 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  38.6 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  41.01 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  40.41 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  38.86 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  38.82 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  33.88 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  30.17 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  45.71 
 
 		 154 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  45.71 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  45.71 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  33.59 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  27.82 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  28.75 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  30.47 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  35.53 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1551  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.74 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2469  hypothetical protein  27.16 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>