73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2008 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  59.17 
 
 
221 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  54.82 
 
 
199 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  49.4 
 
 
192 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  48.81 
 
 
186 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  48.59 
 
 
188 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  48.81 
 
 
186 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  47.62 
 
 
186 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  47.02 
 
 
186 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  48.21 
 
 
186 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  46.67 
 
 
216 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  47.02 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  49.4 
 
 
189 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  48.21 
 
 
189 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  47.88 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  47.88 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  45.83 
 
 
188 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  48.48 
 
 
203 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  44.97 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  44.64 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  42.53 
 
 
191 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  47.53 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  44.31 
 
 
201 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  44.31 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  47.4 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  42.69 
 
 
186 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  40.95 
 
 
207 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  45.89 
 
 
221 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  42.26 
 
 
216 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  42.33 
 
 
188 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  43.71 
 
 
197 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  42.51 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  41.92 
 
 
207 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  42.69 
 
 
203 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  45.21 
 
 
190 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  38.46 
 
 
207 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  42.69 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  40.57 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  41.42 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  38.1 
 
 
197 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  38.32 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  40.35 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  38.67 
 
 
174 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  36.53 
 
 
193 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  37.14 
 
 
201 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  37.13 
 
 
193 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  37.57 
 
 
208 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  37.71 
 
 
201 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  36.36 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  42.57 
 
 
181 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  35.64 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  31.21 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  38.04 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  33.81 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  24.26 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  33.55 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  31.33 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  42.47 
 
 
157 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  26.28 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2469  hypothetical protein  30.41 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  41.1 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  41.1 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  34.62 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  29.85 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>