74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3055 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  88.89 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  74.4 
 
 		 207 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  72.49 
 
 		 190 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  69.35 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  69.35 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  68.21 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  64.04 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  60.4 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  55.84 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  54.59 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  58.72 
 
 		 203 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  54.36 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  59.22 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  53.48 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  57.06 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  59.04 
 
 		 169 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  53.22 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  53.37 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  52.28 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  55.74 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  56.4 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  53.61 
 
 		 189 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  51.81 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  54.49 
 
 		 189 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  55.81 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  54.44 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  54.49 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  51.52 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  54.55 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  55.03 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  55.93 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  50.52 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  53.85 
 
 		 194 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  54.89 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  54.35 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  52.38 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  48.24 
 
 		 192 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  48.96 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  52.66 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  49.73 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  51.48 
 
 		 181 aa  165  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  52.94 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  50.58 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  48.82 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  50.91 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  39.66 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  43.56 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  40.95 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  37.02 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  41.61 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  40.59 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  38.18 
 
 		 181 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  41.72 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  29.35 
 
 		 251 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  40.34 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  38.37 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  37.21 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  36.78 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  36.05 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  36.05 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  29.23 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  34.83 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.69 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  25.17 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  39.39 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>