66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1023 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  47.54 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  43.72 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  41.81 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  40.56 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  41.77 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  41.18 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  44.3 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  40.59 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  44.06 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  41.38 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  40.68 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  42.6 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  40.11 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  39.23 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  38.71 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  42.66 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  38.85 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  40.13 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  39.13 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  42.04 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  40.49 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  39.73 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  38.95 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  40.24 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  39.24 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  37.89 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  45.19 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  36.99 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  41.99 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  38.89 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  32.42 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  38.69 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  39.18 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  37.13 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  37.42 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  38.03 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  39.05 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  35.98 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  36.72 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  38.71 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  37.42 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  37.82 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  39.76 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  38.82 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  35.67 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  36.69 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  32.02 
 
 		 174 aa  94.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  29.41 
 
 		 216 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  36.97 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  36.22 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  38.04 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  31.21 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  27.71 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  30.25 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  29.03 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  26.85 
 
 		 146 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  24.19 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  24.19 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  23.08 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.42 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>