75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1738 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  77.91 
 
 		 163 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  77.3 
 
 		 163 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  80.38 
 
 		 159 aa  258  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  60.38 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  59.75 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  60.62 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  59.75 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  59.35 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  52.99 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  49.25 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  47.76 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  46.62 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  51.22 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1551  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  37.76 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  37.19 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  35.66 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  33.8 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  31.85 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  33.8 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  33.1 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  30.82 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  31.51 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  30.3 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  27.74 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  25.93 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  27.91 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  27.91 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  32.06 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  30.61 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  29.66 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  27.1 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  29.46 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  29.23 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  31.93 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  27.91 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  34.52 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  34.68 
 
 		 197 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  36.25 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  36.25 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  28.38 
 
 		 193 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  28.38 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  31.33 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  40.62 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  28.47 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  30.43 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  39.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  39.06 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  27.69 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  36.84 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  27.69 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  27.86 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  27.42 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  26.83 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  36.25 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  35.42 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  25 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  34.94 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  27.05 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  26.72 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>