74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2486 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  327  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  99.36 
 
 
157 aa  324  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  98.09 
 
 
157 aa  320  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  99.35 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  92.36 
 
 
157 aa  304  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  62.09 
 
 
159 aa  197  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  61.78 
 
 
163 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  61.15 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  60.38 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  52.59 
 
 
146 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  48 
 
 
182 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  53.54 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  48.89 
 
 
147 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  48.63 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1551  hypothetical protein  44.36 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  38.02 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  34.04 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  32.81 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  34.35 
 
 
201 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  29.27 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  35.88 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  33.59 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  34.35 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  32.31 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  30.41 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  34.35 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  29.22 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  29.22 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  29.77 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  29.03 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  45.59 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  38.82 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  44.12 
 
 
189 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  35.34 
 
 
216 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  32.82 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  36.78 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  34.75 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  36.78 
 
 
207 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  50.98 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  50.98 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  42.65 
 
 
203 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  46.3 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  32.31 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  46.3 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  40.28 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  37.18 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  37.18 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  35.65 
 
 
251 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  32.56 
 
 
207 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  48.33 
 
 
253 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  42.62 
 
 
221 aa  50.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  47.27 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  35.79 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  32.06 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  29.71 
 
 
184 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  27.48 
 
 
242 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  32.5 
 
 
197 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  26.32 
 
 
216 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  30 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  41.1 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  29.01 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  28 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  40.62 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  32.18 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  31.96 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>