68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2112 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  47.54 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  47.98 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  50.64 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  44.68 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  42.49 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  49.36 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  49.36 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  45.14 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  51.39 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  44.19 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  44.19 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  43.27 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  43.86 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  43.79 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  46.01 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  45.4 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  43.92 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  45.03 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  43.2 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  42.6 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  50 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  42.69 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  47.62 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  46.47 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  45.4 
 
 		 169 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  43.83 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  45.56 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  41.75 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  47.97 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  43.2 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  41.42 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  44.51 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  47.59 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  43.21 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  43.02 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  41.38 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  47.3 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  41.57 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  41.38 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  44.38 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  44.52 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  40.48 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  38.32 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  41.96 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  40.36 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  32.76 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  39.49 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  33.7 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  39.73 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  37.18 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  30.5 
 
 		 251 aa  89  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  30.11 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  39.79 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  28.64 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  26.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  28.03 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  30.6 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  27.7 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  27.39 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2469  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>