75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1697 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  44.51 
 
 
216 aa  147  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  43.67 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  38.92 
 
 
180 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  39.47 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  39.76 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  36.63 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  35.5 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  41.67 
 
 
203 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  41.88 
 
 
181 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  45.07 
 
 
188 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  39.15 
 
 
203 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  44.37 
 
 
188 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  39.08 
 
 
188 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  39.57 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  38.31 
 
 
174 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  36.81 
 
 
194 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  36.63 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  40.14 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  43.05 
 
 
186 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  41.29 
 
 
189 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  37.8 
 
 
186 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  42.96 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  41.29 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  39.61 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  40.14 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  39.18 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  37.28 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  40.14 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  38.18 
 
 
207 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  39.44 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  35.98 
 
 
186 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  40.52 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  41.01 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  42.45 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  36.26 
 
 
221 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  36.26 
 
 
221 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  37.43 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  40.26 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  38.18 
 
 
207 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  36.99 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  38.24 
 
 
207 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  39.73 
 
 
194 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  35.76 
 
 
221 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  39.04 
 
 
197 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  36.31 
 
 
216 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  34.12 
 
 
190 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  33.52 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  38.92 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  34.52 
 
 
194 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  32.75 
 
 
242 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  35.58 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  37.87 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  36.62 
 
 
208 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  33.81 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  29.3 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  28.47 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  30.56 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  34.52 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  43.86 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  28.57 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  25.35 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  32.73 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  38.24 
 
 
147 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  37.93 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  36.21 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2469  hypothetical protein  30.26 
 
 
193 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>