72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1461 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  98.45 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  88.83 
 
 		 197 aa  349  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  72.16 
 
 		 194 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  66 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  67.55 
 
 		 194 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  57.78 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  55.8 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  55.25 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  56.21 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  58.58 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  54.65 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  55.62 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  55.62 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  55.81 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  55.62 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  53.53 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  53.23 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  58.39 
 
 		 169 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  52.97 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  50.57 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  52.57 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  52.63 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  50.26 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  52.43 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  49.11 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  53.25 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  49.1 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  47.31 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  52.07 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  49.2 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  47.19 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  47.19 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  48.68 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  50.55 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  44.83 
 
 		 186 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  43.16 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  45.4 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  44.83 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  45.9 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  47.62 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  47.62 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  45.29 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  47.56 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  49.36 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  48.23 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  45.06 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  40.56 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  40.99 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  35.29 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  37.43 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  40.52 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  39.75 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  38.5 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  37.13 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  33.33 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  30.84 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  31.13 
 
 		 251 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  35.2 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  33.08 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  28.38 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  32.82 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  32.82 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  32.06 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  32.06 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  30.4 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  36.9 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>