78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1610 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  42.7 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  39.77 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  42.78 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  44.79 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  42.78 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  44.59 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  43.18 
 
 
197 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  43.26 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  41.99 
 
 
216 aa  131  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  42.46 
 
 
188 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  42.69 
 
 
221 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  42.69 
 
 
221 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  42.31 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  41.03 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  41.86 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  41.52 
 
 
221 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  38.86 
 
 
197 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  38.15 
 
 
186 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  41.46 
 
 
203 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  40.12 
 
 
179 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  41.18 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  43.67 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  40.57 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  39.33 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  41.21 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  37.91 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  40.36 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  40.34 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  40.7 
 
 
192 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  41.25 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  40.51 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  40.36 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  40.76 
 
 
169 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  36.63 
 
 
186 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  39.51 
 
 
181 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  37.22 
 
 
194 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  39.26 
 
 
199 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  39.02 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  42.55 
 
 
194 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  39.11 
 
 
216 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  39.08 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  32.43 
 
 
180 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  39.79 
 
 
194 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  40.56 
 
 
207 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  35.57 
 
 
251 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  36.16 
 
 
193 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  35.59 
 
 
193 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  35.8 
 
 
204 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  32.87 
 
 
253 aa  101  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  36.22 
 
 
189 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  38.65 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  36.65 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  35.4 
 
 
222 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  33.73 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  31.85 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  31.13 
 
 
146 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1551  hypothetical protein  35.83 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  28.46 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  30.66 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  27.41 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  27.41 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  29.93 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  29.93 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  29.23 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  30.71 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.86 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  30.88 
 
 
161 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3685  hypothetical protein  37.7 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3754  hypothetical protein  33.73 
 
 
162 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>