76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  80.21 
 
 
189 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  78.61 
 
 
189 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  77.54 
 
 
189 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  75 
 
 
192 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  75.68 
 
 
185 aa  293  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  74.05 
 
 
186 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  74.05 
 
 
186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  73.51 
 
 
186 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  71.89 
 
 
186 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  71.89 
 
 
186 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  61.9 
 
 
216 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  64.63 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  63.31 
 
 
188 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  62.72 
 
 
188 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  58.79 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  56.59 
 
 
201 aa  208  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  59.2 
 
 
221 aa  205  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  59.2 
 
 
221 aa  205  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  58.56 
 
 
186 aa  204  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  60.24 
 
 
203 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  59.22 
 
 
207 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  55.61 
 
 
203 aa  197  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  59.2 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  57.14 
 
 
221 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  60.87 
 
 
169 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  56.14 
 
 
207 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  58.18 
 
 
200 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  59.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  57.93 
 
 
203 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  56.97 
 
 
203 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  59.39 
 
 
201 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  54.97 
 
 
190 aa  184  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  56.97 
 
 
201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  57.14 
 
 
181 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  52.25 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  51.08 
 
 
242 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  48.22 
 
 
197 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  53.38 
 
 
174 aa  168  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  50.54 
 
 
194 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  49.19 
 
 
216 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  49.73 
 
 
193 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  53.29 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  49.2 
 
 
193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  48.33 
 
 
179 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  50.3 
 
 
208 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  48.54 
 
 
194 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  48.59 
 
 
222 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  43.89 
 
 
188 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  40.46 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  47.8 
 
 
199 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  45.06 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  44.44 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  39.08 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  42.46 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  33.88 
 
 
216 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  41.99 
 
 
189 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  33.49 
 
 
253 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  33.5 
 
 
251 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  42.65 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  42.65 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  41.18 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  41.18 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.1 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  29.46 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  29.46 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  43.33 
 
 
147 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  35.79 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  35.87 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1551  hypothetical protein  27.64 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>