75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2791 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  88.89 
 
 
207 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  73.43 
 
 
207 aa  305  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  73.02 
 
 
190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  68.34 
 
 
221 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  68.34 
 
 
221 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  64.53 
 
 
203 aa  261  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  67.69 
 
 
221 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  61.54 
 
 
216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  54.59 
 
 
201 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  56.35 
 
 
200 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  54.08 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  58.14 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  59.2 
 
 
188 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  57.65 
 
 
203 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  51.76 
 
 
203 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  57.54 
 
 
242 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  53.37 
 
 
189 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  54.12 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  51.81 
 
 
216 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  55.87 
 
 
186 aa  184  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  53.22 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  50.77 
 
 
189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  56.63 
 
 
169 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  53.85 
 
 
186 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  55.03 
 
 
186 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  52.66 
 
 
186 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  51.58 
 
 
204 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  54.05 
 
 
193 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  53.98 
 
 
194 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  55.81 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  53.26 
 
 
188 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  52.97 
 
 
193 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  52.72 
 
 
188 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  51.79 
 
 
186 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  52.1 
 
 
186 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  53.25 
 
 
194 aa  174  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  53.25 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  52.02 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  52.66 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  52.63 
 
 
208 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  52.94 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  51.48 
 
 
181 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  45.37 
 
 
197 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  44.75 
 
 
179 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  56.34 
 
 
191 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  38.15 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  41.48 
 
 
194 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  41.61 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  39.08 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  46.47 
 
 
194 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  36.87 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  44.6 
 
 
199 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  44.06 
 
 
189 aa  117  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  38.46 
 
 
222 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  29.85 
 
 
251 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  29.95 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  38.18 
 
 
181 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  38.79 
 
 
221 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  38.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  27.86 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  27.86 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  42.03 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  36.78 
 
 
157 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  34.83 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  40.58 
 
 
154 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  40.58 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  27.82 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.69 
 
 
162 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  39.39 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2469  hypothetical protein  30.08 
 
 
193 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>