75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2272 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1377  protein of unknown function DUF1285  76.19 
 
 		 203 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  73.96 
 
 		 200 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  76.51 
 
 		 201 aa  264  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2625  hypothetical protein  73.81 
 
 		 201 aa  261  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.951563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  71.01 
 
 		 203 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  71.6 
 
 		 203 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15040  hypothetical protein  60.87 
 
 		 188 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3055  protein of unknown function DUF1285  59.04 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  58.54 
 
 		 242 aa  190  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  58.75 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  57.06 
 
 		 216 aa  186  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5173  protein of unknown function DUF1285  57.67 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4478  hypothetical protein  56.44 
 
 		 204 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27076  hitchhiker  0.00151219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0598  hypothetical protein  58.23 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2791  protein of unknown function DUF1285  56.63 
 
 		 207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.237223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25830  hypothetical protein  57.14 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.778013  normal  0.134912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1738  protein of unknown function DUF1285  59.01 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0550433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1458  protein of unknown function DUF1285  59.63 
 
 		 197 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.378117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1642  hypothetical protein  54.6 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  0.867581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2178  hypothetical protein  54.44 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  55.69 
 
 		 216 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2207  hypothetical protein  56.52 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1461  hypothetical protein  58.39 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0455439  normal  0.0296493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1555  hypothetical protein  56.8 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1503  hypothetical protein  56.8 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.4906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2274  hypothetical protein  56.02 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  53.89 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0682  hypothetical protein  53.94 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  53.29 
 
 		 188 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3820  hypothetical protein  51.85 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  53.8 
 
 		 186 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  53.7 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1610  hypothetical protein  53.57 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.325617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  50.9 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1971  hypothetical protein  50.3 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0121726  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1502  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3789  hypothetical protein  51.23 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259527  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1537  hypothetical protein  51.55 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3228  hypothetical protein  53.05 
 
 		 190 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  46.39 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3900  hypothetical protein  51.57 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2766  hypothetical protein  48.78 
 
 		 197 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0693  hypothetical protein  48.21 
 
 		 197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  53.8 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  41.56 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  40.12 
 
 		 194 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2112  hypothetical protein  45.4 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  43.83 
 
 		 199 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4643  hypothetical protein  40.62 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0726  hypothetical protein  40.49 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2008  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1023  hypothetical protein  45.19 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1474  hypothetical protein  36.65 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.07159  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3014  protein of unknown function DUF1285  37.42 
 
 		 221 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15005  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  34.76 
 
 		 216 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1610  hypothetical protein  40.76 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1697  hypothetical protein  35.58 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0647203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2250  hypothetical protein  27.84 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1955  hypothetical protein  26.53 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2479  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2241  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1865  protein of unknown function DUF1285  32.06 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071234  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2599  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2642  hypothetical protein  32.31 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2486  hypothetical protein  31.3 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1594  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.1666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1738  hypothetical protein  27.91 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1669  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2547  hypothetical protein  26.32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2295  hypothetical protein  34.15 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1873  hypothetical protein  29.32 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000126368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2713  hypothetical protein  25.58 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0755698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2007  hypothetical protein  30.68 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>