69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2617 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2617  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 333 aa  689    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0097  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.8 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2092  cyclic nucleotide-binding protein  27.2 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.052922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 232 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  27.83 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 215 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  23.68 
 
 		 415 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 171 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.74 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.99 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27 
 
 		 239 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.44 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  21.24 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.54 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.69 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  19.7 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.05 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0465  hypothetical protein  30.34 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  21.21 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.78 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  24.41 
 
 		 232 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 		 229 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  24.41 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  21.8 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  20 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  27.19 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  32.89 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2161  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.776076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  23.93 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  23.15 
 
 		 210 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.05 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  23.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1179  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.05 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  22.52 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  21.5 
 
 		 577 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 179 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3707  hypothetical protein  28.74 
 
 		 563 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  22.66 
 
 		 210 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.74 
 
 		 563 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  20.66 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25.47 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  22.93 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>