More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TCA03 on replicon NC_002182
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002182  TCA03  virulence plasmid helicase pGP1-D  100 
 
 
451 aa  919    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
444 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  31.82 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  32.45 
 
 
445 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  42.06 
 
 
444 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  31.59 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  36.36 
 
 
450 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
496 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  30.94 
 
 
453 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  31.07 
 
 
449 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
318 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
506 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  31.01 
 
 
495 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  36.86 
 
 
471 aa  190  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  36.86 
 
 
471 aa  190  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  37.8 
 
 
505 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  39.29 
 
 
456 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.76 
 
 
453 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  31.34 
 
 
495 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  31.34 
 
 
495 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  42.97 
 
 
446 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
476 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  37.58 
 
 
495 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  37.09 
 
 
498 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  31.01 
 
 
495 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
476 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  38.66 
 
 
463 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  40 
 
 
459 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  42.47 
 
 
437 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  37.58 
 
 
497 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  31.13 
 
 
495 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  30.77 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  30.77 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0784  replicative DNA helicase  42.35 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  31.74 
 
 
481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  36.96 
 
 
497 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  31.28 
 
 
468 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  30.6 
 
 
469 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  36.24 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
469 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  35.43 
 
 
499 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  37.73 
 
 
496 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  40 
 
 
448 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  36.79 
 
 
442 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  36.96 
 
 
503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  37.79 
 
 
500 aa  180  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  35.26 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  40.45 
 
 
473 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.46 
 
 
445 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  34.43 
 
 
466 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  34.9 
 
 
498 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  34.43 
 
 
466 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  34.43 
 
 
466 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  39.03 
 
 
446 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  39.47 
 
 
462 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  39.47 
 
 
462 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
440 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  38.81 
 
 
443 aa  179  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  35.23 
 
 
498 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  36.42 
 
 
473 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  38.49 
 
 
451 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  32.06 
 
 
464 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  30.67 
 
 
441 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  33.25 
 
 
524 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  38.63 
 
 
525 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
472 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  35.45 
 
 
502 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  32.06 
 
 
464 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  36.67 
 
 
456 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  38.28 
 
 
449 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  30.82 
 
 
461 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  38.28 
 
 
449 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  36.15 
 
 
493 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  36.57 
 
 
456 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  37.33 
 
 
499 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  29.59 
 
 
446 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  39.53 
 
 
473 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  38.95 
 
 
470 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  37.6 
 
 
442 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  36.67 
 
 
496 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  31.08 
 
 
447 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  39.37 
 
 
454 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  39.37 
 
 
454 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  36.54 
 
 
463 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  34.56 
 
 
498 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  30.68 
 
 
470 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  36.98 
 
 
445 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
442 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  30.11 
 
 
472 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  30.22 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0107  replicative DNA helicase  40.08 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.598897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>