More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0784 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0784  replicative DNA helicase  100 
 
 
472 aa  967    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  39.64 
 
 
445 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  40.09 
 
 
446 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  39.42 
 
 
448 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  39.56 
 
 
442 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  39.42 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
459 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  38.71 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.42 
 
 
453 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
453 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  38.8 
 
 
460 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  39.2 
 
 
449 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  39.6 
 
 
449 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
449 aa  326  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  39.65 
 
 
440 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  39.82 
 
 
449 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  38.7 
 
 
476 aa  322  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  39.22 
 
 
456 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  39.02 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  39.6 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  39.87 
 
 
454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  39.36 
 
 
461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  39.47 
 
 
450 aa  319  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  39.87 
 
 
454 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  39.06 
 
 
444 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  39.18 
 
 
462 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
461 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  38.05 
 
 
447 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  39.41 
 
 
468 aa  316  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  40.4 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  39.47 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.35 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  38.68 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  39.96 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  38.68 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.26 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  40.48 
 
 
465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  37.58 
 
 
442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  40.22 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  36.9 
 
 
481 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  38.95 
 
 
458 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  40.04 
 
 
446 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  36.36 
 
 
441 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  39.75 
 
 
468 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  39.75 
 
 
468 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  40.22 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  38.33 
 
 
453 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  40 
 
 
445 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  39.53 
 
 
468 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  38.53 
 
 
454 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
470 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  39.05 
 
 
468 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  38.07 
 
 
443 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  37.18 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  37.77 
 
 
469 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  39.91 
 
 
468 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  39.11 
 
 
468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  41.11 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  39.34 
 
 
456 aa  309  6.999999999999999e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  39.01 
 
 
466 aa  309  8e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  38.68 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  39.1 
 
 
472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  38.23 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  38.91 
 
 
473 aa  306  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  37.88 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  40.38 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  38.77 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  40.31 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  38.92 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  38.79 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  37.69 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
468 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  38.99 
 
 
465 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  37.42 
 
 
529 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  38.44 
 
 
463 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  38.58 
 
 
525 aa  302  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  38.65 
 
 
477 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  38.56 
 
 
468 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  38.77 
 
 
470 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  37.75 
 
 
473 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  38.95 
 
 
468 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  38.2 
 
 
461 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>