113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4020 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  28.43 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  28.96 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 		 682 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  23.93 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.83 
 
 		 734 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.61 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  23.21 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  33.96 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  24.9 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  23.02 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 		 770 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  34.51 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.8 
 
 		 778 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.44 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  25.76 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  25.76 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.54 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  25.76 
 
 		 461 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 772 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  24.42 
 
 		 454 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  25.76 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  25.38 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.9 
 
 		 839 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.26 
 
 		 781 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 		 761 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.91 
 
 		 783 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 		 837 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 		 393 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  21.85 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  22.71 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 451 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  24.81 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  25.74 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  24.02 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.34 
 
 		 773 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.22 
 
 		 773 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.34 
 
 		 654 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  23.08 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.58 
 
 		 749 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.74 
 
 		 785 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  19.31 
 
 		 829 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  28.16 
 
 		 879 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  23.29 
 
 		 826 aa  49.3  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.61 
 
 		 868 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.67 
 
 		 780 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.41 
 
 		 775 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  22.06 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.31 
 
 		 773 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  32.32 
 
 		 773 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  20 
 
 		 806 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.31 
 
 		 773 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  25.34 
 
 		 808 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.27 
 
 		 833 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  22.54 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.61 
 
 		 750 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 772 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 772 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.13 
 
 		 808 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.7 
 
 		 801 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.58 
 
 		 761 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  22.18 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  22.18 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  22.18 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  22.18 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  25.68 
 
 		 115 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.4 
 
 		 878 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.08 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.23 
 
 		 726 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.23 
 
 		 726 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  19.31 
 
 		 825 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.31 
 
 		 822 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.22 
 
 		 773 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  22.18 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  22.37 
 
 		 937 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl369  DNA uptake protein  32 
 
 		 607 aa  43.9  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.399e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  40.79 
 
 		 813 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>