18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5652 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  46.68 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  22.55 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  22.93 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  19.35 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  39.51 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  23.15 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.5 
 
 		 800 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.12 
 
 		 790 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.05 
 
 		 791 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.32 
 
 		 837 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>