44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1822 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
305 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
345 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  25.29 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  25.21 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  39.39 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  23.32 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  24.01 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  19.02 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  21.18 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  21.88 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  21.88 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  21.88 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.48 
 
 
796 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  20.07 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  20.42 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  21.18 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  21.18 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  21.53 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.19 
 
 
795 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  21.88 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  21.63 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.05 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.05 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  21.53 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  21.63 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  22.7 
 
 
352 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  21.53 
 
 
300 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.77 
 
 
795 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  27.42 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  27.42 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  23.97 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.07 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  26.47 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  26.88 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  23.24 
 
 
872 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  20 
 
 
427 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  20.15 
 
 
294 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>