17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2739 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  735    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  769    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3039  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.357616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  38.39 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  34.63 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  38.27 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  21.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  34.12 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  34.12 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  40 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  40 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  40 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.79 
 
 		 761 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  27.83 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  23.53 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>