63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0217 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.8 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  38.39 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  38.39 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3039  beta-lactamase-like protein  39.19 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.357616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  35.14 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  24.32 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  23.48 
 
 		 461 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  23.48 
 
 		 461 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 		 795 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  37.63 
 
 		 937 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  33.01 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  30.94 
 
 		 795 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  23.17 
 
 		 461 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  23.17 
 
 		 461 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  23.38 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.96 
 
 		 840 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  41.86 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.41 
 
 		 797 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  30.69 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.04 
 
 		 814 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 883 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  25.38 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.23 
 
 		 778 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.87 
 
 		 771 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.29 
 
 		 808 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 451 aa  49.7  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  35.23 
 
 		 900 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.26 
 
 		 846 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 		 796 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  34.38 
 
 		 735 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 		 757 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 735 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2450  ComEC/Rec2-related protein  34.88 
 
 		 1100 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  24.28 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  35.63 
 
 		 979 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  30.1 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.61 
 
 		 798 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 423 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  35.9 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>