45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2035 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 363 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  38.8 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  34.63 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  34.63 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3039  beta-lactamase-like protein  34.55 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.357616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  24.6 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 		 796 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.05 
 
 		 883 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.33 
 
 		 795 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  21.32 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3184  cobyric acid synthase CobQ  26.07 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.999187  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.21 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.21 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.21 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  30.67 
 
 		 795 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  22.07 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  35.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0732  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  21.48 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  32.14 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.64 
 
 		 761 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.51 
 
 		 840 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  35.29 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  32.14 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.59 
 
 		 770 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.2 
 
 		 948 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.87 
 
 		 682 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 		 284 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>