19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0864 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  100 
 
 		 289 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  38.27 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  38.27 
 
 		 371 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3039  beta-lactamase-like protein  37.97 
 
 		 268 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.357616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  35.14 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.22 
 
 		 363 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  22.76 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  24.38 
 
 		 427 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  24.24 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.02 
 
 		 795 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  36.25 
 
 		 795 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.25 
 
 		 796 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.29 
 
 		 778 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  33.71 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>