15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3039 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3039  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.357616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2607  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.745873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  39.19 
 
 		 359 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  34.12 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  34.12 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  27.23 
 
 		 461 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  40 
 
 		 461 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  40 
 
 		 461 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  27.83 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  27.83 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 		 846 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>